Дом призрения бедных при Большеохтинском кладбище учрежден потомственным дворянином Степаном Петровичем Елисеевым в память его родителей Петра Степановича и Любови Дмитриевны, а также деда его Степана Петровича и Анны Гавриловны Елисеевых.
В 1881–1885 годах П. С. Елисеев по завещанию отца построил церковь во имя Казанской иконы Божией Матери (архитекторы К. К. Вергейм и Ф. Л. Миллер), которая стала семейной усыпальницей Елисеевых – сюда перенесли с кладбища останки всех представителей семейства, во главе с родоначальником фамилии П. Е. Елисеевым.
В 1903 году рядом с церковью, на участке в 1 200 квадратных сажен на средства Елисеевых был устроен Дом призрения бедных. Целью Дома призрения было предоставить приют и полное содержание бедным, престарелым и неспособным к труду лицам обоего пола, всех сословий и званий православного вероисповедания.
Для Дома призрения было построено отдельное трехэтажное каменное здание. Строительство началось 17 сентября 1900 года на средства статского советника Петра Степановича Елисеева под его личным наблюдением, а закончено 1 мая 1904 года его сыном, учредителем дома призрения С. П. Елисеевым. При открытии Дома призрения учредитель внес неприкосновенный капитал в 503 тысяч рублей государственными процентными бумагами по номинальной стоимости. В заведении на деньги Елисеевых содержалось ежегодно до 150 человек – 120 стариков и 30 детей –, здесь же находилась амбулатория и школа.
Постоянным попечителем богадельни был сын П. С. Елисеева – Степан Петрович – вице-президент Русского для внешней торговли банка, пожертвовавший на ее строительство, оборудование и обеспечение 1 104 тысяч рублей, из них 504 тысячи – в неприкосновенный капитал. Благодаря этому щедрому дару он получил чин действительного статского советника и потомственное дворянство. Помощниками попечителя стали его жена Варвара Сергеевна и сын Петр. В богадельне опекалось 10 мужчин-стариков, 40 женщин старше 50 лет и 30 их детей, имелись амбулатория и школа. Сюда не принимали алкоголиков, страдающих наследственными или заразными болезнями и психически нездоровых людей. Под страхом отчисления призреваемым запрещалось принимать милостыню от посторонних, ибо жили они «на всем готовом», и хоронили их за счет заведения у храма.
После революции Дом призрения был закрыт, в 1929 году снесли храм. Сейчас в здании находится второй корпус Гидрометеорологического Университета.